Khi cơ thể đưa máu đến tim, tim sẽ bơm oxy vào máu. Sau đó, các động mạch vận chuyển máu giàu oxy đến các khu vực khác nhau của cơ thể. Động mạch trực tràng dưới mang máu có oxy đến phần dưới của hậu môn và ống hậu môn. Ống hậu môn là phần cuối của ruột già có chức năng đẩy chất thải vào trực tràng để tống ra ngoài cơ thể.
Động mạch này phân nhánh từ động mạch lưng trong, cung cấp lưu lượng máu đến cơ quan sinh dục nằm bên ngoài cơ thể, chẳng hạn như dương vật. Các nhánh động mạch thành ba đoạn bắt chéo qua xương của khung chậu. Mỗi nhánh cung cấp máu cho các cơ nằm ở vùng hậu môn.
Động mạch trực tràng dưới cung cấp máu có oxy cho cơ mông, là cơ lớn nhất ở mông của con người. Động mạch cũng cung cấp máu cho vùng da mông. Sau đó, các động mạch vòng quanh cơ thể và kết nối với các mạch máu của trực tràng và động mạch đáy chậu.
